Kostel svaté Alžběty se nachází v jižní části Třeboně II, blízko sídliště Hliník. Jde o hřbitovní a filiální chrám spravovaný Římskokatolickou farností Třeboň. Jeho vznik v druhé polovině 16. století связан se jménem mocného rožmberského pána Viléma z Rožmberka, který jej dal postavit jako náhradu za starší gotický kostel stejného zasvěcení, který byl zrušen. Původní chrám stál na místě nynějšího ostrova v rybníce Svět, kterou v té době vytvářeli. Nový kostel byl vystavěn v renesančním slohu a s jedinou lodí. Slavnostní vysvěcení se uskutečnilo 26. července 1576 s požehnáním papeže Řehoře XIII.

Stavba nese zajímavé stopy své doby a dějin. Závěr a presbytář chrámu ukrývají výrazné pozdně gotické prvky, zvlášť v řešení oken, zatímco omítka je typicky renesanční. Sanktusník a dvojitá báň hlavní věže jsou provedeny v barokním stylu. V kostele se nachází barокní hlavní oltář s obrazem „Umírání Páně" od Petra van Roye z roku 1666. K dalšímu vybavení patří dva barокní oltáře přemístěné sem v druhé polovině 18. století – oltář svatého Jana Nepomuckého z hlavního děkanského kostela a oltář svaté Barbory ze zrušeného kostela svatého jména. Z roku 1654 pochází zvon zasvěcený patronce chrámu i svaté Barboře, kterou přenesli ze zrušeného gotického kostela svaté Barbory. Protože unikl pozornosti během světových válek, na rozdíl od ostatních třeboňských zvonů, patří v roce 2018 k nejstarším zvonům ve městě.

Chrám se stal místem významné historické epizody. Dva roky po Bitvě na Bílé Hoře se u kostela dojednával mír mezi bělohorskými vítězi, reprezentovanými generálem Baltasarem Marradasem i Vichem, a anglickou posádkou města Třeboně. Posádka si vymohla volný odchod a slušné zacházení. V novější historii byl kostel v roce 2009 jediným chrámu v českobudějovické diecézi, kde se pravidelně konala tzv. tridentská mše, vždy v první neději v měsíci.

Přilehlý Třeboňský městský hřbitov patří k nejzajímavějším místům lokality. Nachází se poblíž kostela a obsahuje hrobky a hroby významných třeboňských osob, mezi nimi opatů a děkanů. V jeho blízkosti jsou rozptýleny barokní stavby – výklenková kaple s polychromovanou kamennou sochou Panny Marie, kříž s Ježíšem a Pannou Marií s nápisy, renesanční dům bývalého Krčínova správce a barокní dvůr. Dům čp. 80, postaven roku 1709 Schwarzenberským hejtmanem Karlem Siebertem Hoffbauerem z Liliensteinu, má barokní sluneční hodiny. V ulici Svobody stojí barокní boží muka se sochou, která má od roku 2022 barevný obraz Panny Marie z Medžugorie. Nedaleko se zachoval velký železný kříž s Ukřižovaným z roku 1842.

Návštěva kostela a okolního hřbitova vede k setkání se slojitou stavební historií místa a osobitou atmosférou místa spjatého s třeboňským duchovním a veřejným životem.